EC番号

数千ある酵素を分類するため、便利なEC番号なるものがあります。

反応の種類や基質を示す番号を並べたもので、番号で酵素が特定できます。

アミラーゼ(ジアスターゼ)であれば EC.3.2.1.1、アルコールデヒドロゲナーゼ(アルコール脱水素酵素)であれば EC.1.1.1.1, EC.1.1.1.2, EC.1.1.1.71 など。

最初の番号は反応の種類を示したものです。

EC.1. — オキシドレダクターゼ(酸化還元酵素)
EC.2. — トランスフェラーゼ(転移酵素)
EC.3. — ヒドロラーゼ(加水分解酵素)
EC.4. — リアーゼ(脱離酵素)
EC.5. — イソメラーゼ(異性化酵素)
EC.6. — リガーゼ(合成酵素)

EC.1. オキシドレダクターゼ oxidoreductase(酸化還元酵素)



オキシドレダクターゼ(酸化還元酵素)は酸化還元反応を触媒します。

オキシドレダクターゼは反応の種類で、脱水素酵素(デヒドロゲナーゼ dehydrogenase)、電子の移動(シトクロム cytochrome など)、酸化酵素(オキシダーゼ oxidase)など分類されます。

シトクロム

シトクロム cytochrome はヘム鉄を持つヘムタンパク質です。ヘム鉄の鉄イオンは酸化還元作用を持ちます。

シトクロムc

シトクロムcは水溶性で、カスパーゼを活性化することでアポトーシスを引き起こします。[*]

In TCA cycle, cytochrome aa3 transports electron to oxygen, which are subject to CO and cyanide poisoning. Cytochrome b5 and P450 are found on ER.

フラボタンパク質

フラボタンパク質 flavoproteins
Flavoproteins binds to FMN or FAD as prosthetic groups.
Figure 7: Flavin
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L-amino acid oxidase oxidize L-amino acids.
xanthine oxidase converts purine to urine.
aldehyde dehydrogenase contains molybdenum and non-heme iron.
glucose oxidase prepared from fungi.
flavin nucleotides forms a radical.

脱水素酵素(デヒドロゲナーゼ dehydrogenase)

Many dehydrogenases acts with NAD+ or NADP+ from niacin as coenzymes, such as alcohol dehydrogenase and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. NADH dehydrogenase, succinate dehydrogenase, acetyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial glycerol-4-phosphate dehydrogenase, and electron-transferring flavoprotein contains riboflavin. Peroxidases and Catalases Peroxidases remove electron from hydrogen peroxide to electron acceptors such as ascorbate, quinones, and cytochrome c. Glutathione peroxidase in the erythrocytes contains selenium and catalyze the destruction of H2O2. Catalase in blood, bone marrow, mucous membranes, kidney, and liver contains four hemes catalyzes the destruction of H2O2. Peroxisomes(microbodies) contains both catalases and oxidases.

オキシゲナーゼ oxygenase


オキシゲナーゼ oxygenase(ヒドロキシラーゼ hydroxylase)は基質が酸素原子を取り込む反応を触媒します。
Homogentisate dioxygenase, 3-hydroxyanthranilate dioxygenase, and Ltryptophan dioxygenase(tryptophan pyrrolase) contains iron and are dioxygenases. Cytochrome P450 and cytochrome b5 incorporate oxygen in the hydroxylase cycle. The hydroxylase cycle involves the metabolism of benzpyrene, aminopyrine, aniline, morphine, and benzphetamine. Phenobarbital induces formation of microsomal enzymes and of cytochrome P450. Cytochrome P450 catalyze steroidal hydroxylations. Superoxide free radical O2are formed reduced flavins are reoxidized. Superoxide can reduce oxidized cytochrome c. Superoxide dismutase converts free radicals to H2O2. The superoxide dismutase in cytoplasm contains Cu2+ and Zn2+, whereas mitochondrial enzyme contains Mn2+ as in bacteria which suggests the linkage between the mitochondrial symbiosis with prokaryotes. Vitamin E( -tocopherol) is an antioxidant.